Metabolizm styrypentolu jest katalizowany przez CYP1A2, CYP2C19 i CYP3A4, niewykluczone, że również i inne enzymy - należy zachować ostrożność podczas stosowania styrypentolu z induktorami lub inhibitorami tych izoenzymów. Nie wiadomo, jaki jest wpływ makrolidów oraz przeciwgrzybiczych pochodnych azolowych, które są inhibitorami CYP3A4 i jego substratów, na metabolizm styrypentolu; nie jest znany także wpływ styrypentolu na ich metabolizm. Nie ustalono jednoznacznie wpływu innych leków przeciwpadaczkowych na farmakokinetykę styrypentolu. Styrypentol w znacznym stopniu hamuje aktywność CYP450, np. CYP2C19, CYP2D6 oraz CYP3A4. Może zwiększać stężenie we krwi substratów CYP2C19 (np. cytalopram, omeprazol) lub CYP3A4 (np. inhibitory proteazy HIV, blokery kanałów wapniowych, statyny, doustne środki antykoncepcyjne, kodeina, leki przeciwhistaminowe - astemizol, chlorfeniramina), nasilając ich toksyczność; zaleca się monitorowanie stężeń tych leków we krwi lub obserwację w kierunku działań niepożądanych, może być konieczna modyfikacja dawkowania. Należy unikać stosowania styrypentolu z substratami CYP3A4 o wąskim indeksie terapeutycznym, z uwagi na znaczne zwiększenie ryzyka ciężkich działań niepożądanych. Może zwiększać stężenie we krwi leków przeciwpadaczkowych, będących substratami CYP2C19 i CYP3A4, takich jak: fenobarbital, prymidon, fenytoina, karbamazepina, klobazam, walproinian, diazepam (nasilenie działania miorelaksacyjnego), etosuksymid i tiagabina; z uwagi na ryzyko przedawkowania ww. leków zaleca się monitorowanie ich stężenia we krwi i w razie konieczności modyfikację dawkowania. Dodanie topiramatu do schematu leczenia styrypentolem w skojarzeniu z klobazamem i walproinianem, nie wymaga modyfikacji dawkowania. Lewetyracetam nie podlega metabolizmowi wątrobowemu w znacznym stopniu, nie należy spodziewać się metabolicznych interakcji farmakokinetycznych styrypentolu z lewetyracetamem. Styrypentol może zwiększać stężenie we krwi substratów CYP2D6, takich jak: β-adrenolityki (propranolol, karwedilol, tymolol), leki przeciwdepresyjne (fluoksetyna, paroksetyna, sertralina, imipramina, klomipramina), leki przeciwpsychotyczne (haloperydol) lub przeciwbólowe (kodeina, dekstrometorfan, tramadol); konieczna może być modyfikacja dawki w przypadku substancji o indywidualnie dobieranym schemacie dawkowania, metabolizowanych przez izoenzym CYP2D6. Dostępne są jedynie ograniczone dane na temat hamowania układu CYP1A2, zatem nie można wykluczyć zwiększenia stężenia z teofiliny i kofeiny, z ryzykiem wystąpienia objawów toksycznych - nie zaleca się jednoczesnego stosowania tych związków ze styrypentolem; dotyczy to również artykułów spożywczych i produktów przeznaczonych dla dzieci. Pacjenci nie powinni spożywać napojów typu cola, zawierających znaczne ilości kofeiny, ani czekolady, zawierającej śladowe ilości teofiliny. Niezalecane skojarzenia leków (należy ich unikać, chyba że są bezwzględnie konieczne): alkaloidy sporyszu (takie jak ergotamina, dihydroergotamina) - zatrucie alkaloidami sporyszu zagrażające martwicą kończyn (hamowanie eliminacji wątrobowej alkaloidów sporyszu żytniego); cyzapryd, halofantryna, pimozyd, chinidyna, beprydyl - zwiększenie ryzyka arytmii serca, szczególnie typu torsades de pointes lub wave burst; leki immunosupresyjne (takrolimus, cyklosporyna, syrolimus) - zwiększenie stężenia leków immunosupresyjnych we krwi (zaburzenie metabolizmu wątrobowego); statyny (atorwastatyna, symwastatyna itp.) - zwiększenie ryzyka zależnych od dawki działań niepożądanych, np. rabdomiolizy (zaburzenie metabolizmu wątrobowego inhibitorów reduktazy HMG-CoA. Skojarzenia leków wymagające stosowania środków ostrożności: midazolam, triazolam, alprazolam - zwiększenie stężenia benzodiazepin we krwi z ryzykiem nadmiernej sedacji; chlorpromazyna - styrypentol nasila ośrodkowe działanie hamujące chlorpromazyny.