Welpataswir jest inhibitorem transportera leków P-gp, białka oporności raka piersi (BCRP), polipeptydu transportującego aniony organiczne (OATP) 1B1 oraz OATP1B3. Równoczesne podawanie z produktami leczniczymi będącymi substratami tych transporterów może nasilić ekspozycję na te produkty lecznicze. Sofosbuwir i welpataswir są substratami transportera leków P-gp i BCRP. Welpataswir jest także substratem transportera leków OATP1B. Produkty lecznicze będące silnymi induktorami P-gp lub CYP2B6, CYP2C8 bądź CYP3A4 (np. karbamazepina, fenobarbital, fenytoina, ryfampicyna, ryfabutyna oraz ziele dziurawca zwyczajnego) mogą zmniejszać stężenie sofosbuwiru i welpataswiru w osoczu, prowadząc do zmniejszenia działania terapeutycznego preparatu – jednoczesne podawanie jest przeciwwskazane. Substancje będące umiarkowanymi induktorami P-gp lub CYP (np. efawirenz, modafinil, okskarbazepina lub ryfapentyna) mogą zmniejszać stężenie sofosbuwiru lub welpataswiru w osoczu - nie zaleca się jednoczesnego stosowania. Równoczesne podawanie z produktami leczniczymi hamującymi P-gp lub BCRP może zwiększać stężenie sofosbuwiru lub welpataswiru w osoczu. Produkty lecznicze hamujące OATP, CYP2B6, CYP2C8 lub CYP3A4 mogą zwiększać stężenie welpataswiru w osoczu. Nie oczekuje się wystąpienia istotnych klinicznie interakcji z preparatem, w których pośredniczą inhibitory P-gp, BCRP, OATP lub CYP450 – można podawać jednocześnie. Rozpuszczalność welpataswiru zmniejsza się wraz ze wzrostem pH. Oczekuje się, że produkty lecznicze zwiększające pH w żołądku będą zmniejszać stężenie welpataswiru. Zaleca się, aby między podaniem leku zobojętniającego sok żołądkowy i preparatu upłynęły 4 h. Antagonistów receptora H2 można podawać równocześnie lub naprzemiennie z preparatem w dawce nieprzekraczającej dawek porównywalnych z famotydyną 40 mg 2 razy na dobę. Równoczesne stosowanie z inhibitorami pompy protonowej nie jest zalecane. Jednak jeżeli jest to konieczne, preparat należy przyjmować z pożywieniem 4 h przed przyjęciem IPP w maksymalnej dawce porównywalnej do 20 mg omeprazolu. Z amiodaronem stosować wyłącznie w przypadku braku dostępności alternatywnych metod leczenia – ryzyko bradykardii i bloku sercowego. Równoczesne podawanie z digoksyną może zwiększać stężenie digoksyny - należy zachować ostrożność i kontrolować jej stężenie. Zaleca się monitorowanie kliniczne zwracając uwagę na oznaki krwawienia i niedokrwistości w przypadku równoczesnego stosowania eteksylanu dabigatranu. Pacjentom leczonym antgonistami witaminy K należy ściśle monitorować wartości międzynarodowego współczynnika znormalizowanego (INR). Zmiany czynności wątroby podczas leczenia DAA, związane z eliminacją zakażenia HCV, mogą wpływać na farmakokinetykę leków metabolizowanych w wątrobie (np. leków immunosupresyjnych, takich jak inhibitory kalcyneuryny). Preparat znacząco zwiększa ekspozycję na tenofowir – należy monitorować pacjentów, pod kątem możliwych działań niepożądanych tenofowiru. Równoczesne podawanie z rozuwastatyną zwiększa stężenie rozuwastatyny, co związane jest ze zwiększonym ryzykiem miopatii, w tym rabdomiolizy. Rozuwastatyna, w dawce nieprzekraczającej 10 mg, może być podawana z preparatem Epclusa. Nie jest konieczne dostosowanie dawek preparatu ani prawastatyny. Nie można wykluczyć interakcji z innymi inhibitorami reduktazy HMG-CoA. Podczas równoczesnego stosowania należy uważnie monitorować pod kątem działań niepożądanych statyn i w razie potrzeby rozważyć zmniejszenie ich dawki. Nie jest konieczne dostosowywanie dawek w przypadku równoczesnego stosowania leku z ketokonazolem, atorwastatyną, metadonem, cyklosporyną (w trakcie leczenia może być wymagane dokładne monitorowanie i ewentualne dostosowanie dawki), takrolimusem (w trakcie leczenia może być wymagane dokładne monitorowanie i ewentualne dostosowanie dawki) czy doustnymi środkami antykoncepcyjnymi.