Raltegrawir nie jest substratem enzymów cytochromu P450 (CYP), nie hamuje aktywności CYP1A2, CYP2B6, CYP2C8, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 czy CYP3A, nie indukuje CYP3A4 ani nie hamuje procesów transportu, w których pośredniczy glikoproteina P - interakcje wynikające z tych mechanizmów są mało prawdopodobne. Raltegrawir eliminowany jest głównie w wyniku glukuronidacji, w której pośredniczy UGT1A. Ryfampicyna (silny induktor UGT1A1) powoduje zmniejszenie stężenia raltegrawiru we krwi - jeśli nie można uniknąć takiej terapii skojarzonej, należy rozważyć podwojenie dawki raltegrawiru (u pacjentów dorosłych). Brak danych dotyczących jednoczesnego podawania raltegrawiru z ryfampicyną u pacjentów w wieku <18 lat. Inne induktory UGT1A1, takie jak: typranawir/rytonawir, efawirenz, etrawiryna, newirapina, ryfabutyna, glikokortykosteroidy, ziele dziurawca, pioglitazon można podawać z zalecaną dawką raltegrawiru. Nie jest znany wpływ innych silnych induktorów enzymów biorących udział w metabolizmie leków, takich jak fenytoina i fenobarbital, na UGT1A1. Stosowanie raltegrawiru silnymi inhibitorami UGT1A1 (np. atazanawirem), może powodować zwiększenie stężeń raltegrawiru we krwi. Słabsze inhibitory UGT1A1 (np. indynawir, sakwinawir) mogą także powodować zwiększenie stężeń raltegrawiru we krwi, ale w mniejszym stopniu niż atazanawir. Tenofowir może powodować zwiększenie stężenia raltegrawiru we krwi, chociaż nie jest znany mechanizm tego zjawiska. Profil bezpieczeństwa u pacjentów przyjmujących atazanawir i (lub) tenofowir był na ogół zbliżony do profilu obserwowanego u pacjentów niestosujących tych leków, z tego względu nie jest konieczna modyfikacja dawki. Leki zobojętniające kwas solny w żołądku, zawierające glin i magnez, podane w ciągu 2 h od podania raltegrawiru znacznie zmniejszają jego stężenie we krwi - nie zaleca się jednoczesnego podawania. Leki zobojętniające kwas solny w żołądku, zawierające węglan wapnia, także zmniejszają stężenie raltegrawiru we krwi, jednak to oddziaływanie nie jest uznawane za istotne klinicznie - nie jest konieczna zmiana dawki raltegrawiru. Jednoczesne podawanie raltegrawiru z lekami powodującymi podwyższenie pH soku żołądkowego (np. omeprazolem i famotydyną) może powodować zwiększenie wchłaniania raltegrawiru, co będzie skutkowało jego zwiększonym stężeniem we krwi - profile bezpieczeństwa w grupie pacjentów przyjmujących inhibitory pompy protonowej lub antagonistów receptora H2 były porównywalne z profilami obserwowanymi u pacjentów niestosujących tych leków, dlatego nie jest konieczna zmiana dawki raltegrawiru podczas stosowania inhibitorów pompy protonowej lub antagonistów receptora H2. Oczekuje się, że jednoczesne podanie soli żelaza zmniejsza stężenie raltegrawiru w osoczu; przyjmowanie soli żelaza co najmniej 2 h od podania raltegrawiru moze pozwolić na ograniczenie tego efektu. W przypadku stosowania z marawirokiem, boceprewirem, tenofowirem, etawiryną, metadonem, midazolamem, hormonalnymi środkami antykoncepcyjnymi (etynylostradiol, norelgestromina) nie ma konieczności zmiany dawkowania raltegrawiru ani jednocześnie stosowanych ww. leków. W niektórych badaniach równoczesne podawanie raltegrawiru i darunawiru powodowało nieznaczne zmniejszenie stężenia darunawiru we krwi, jednak wpływ raltegrawiru na stężenia darunawiru wydaje się nie mieć znaczenia klinicznego; w trakcie terapii skojarzone z darunawierem istnieje zwiększone ryzyko wystąpienia wysypki.